Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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PTPN13Q12923 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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