Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GGA3Q9NZ52 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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