Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.6 ms