Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD4Q12950 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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