Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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