Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gadd45gip1Q9CR59 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms