Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl27Q99N92 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms