Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24CP53992 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC24CP53992 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms