Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif3aP28741 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms