Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GGA3Q9NZ52 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GGA3Q9NZ52 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GGA3Q9NZ52 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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