Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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