Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KLF9Q13886 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF9Q13886 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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