Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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