Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
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