Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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