Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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