Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GGA3Q9NZ52 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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