Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms