Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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GRIK3Q13003 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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GRIK3Q13003 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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GRIK3Q13003 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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GRIK3Q13003 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIK3Q13003 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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