Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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PTPRTO14522 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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PTPRTO14522 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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