Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPN13Q12923 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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