Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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FOXD4Q12950 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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FOXD4Q12950 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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FOXD4Q12950 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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FOXD4Q12950 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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