Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms