Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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