Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KLF9Q13886 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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