Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt71Q9R0H5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms