Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssxb10Q6XAR7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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