Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPN13Q12923 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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