Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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