Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRTO14522 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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