Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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