Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RDH8Q9NYR8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.3 ms