Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933402E13RikQ9D4D2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms