Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms