Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Mbd3Q9Z2D8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd3Q9Z2D8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd3Q9Z2D8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Mbd3Q9Z2D8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms