Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpastQ9QYY8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpastQ9QYY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SpastQ9QYY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SpastQ9QYY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SpastQ9QYY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms