Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJH1

Rnase4, Ribonuclease 4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnase4Q9JJH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnase4Q9JJH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnase4Q9JJH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnase4Q9JJH1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnase4Q9JJH1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnase4Q9JJH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnase4Q9JJH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms