Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copz2Q9JHH9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copz2Q9JHH9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copz2Q9JHH9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copz2Q9JHH9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms