Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stx12Q9ER00 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx12Q9ER00 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx12Q9ER00 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx12Q9ER00 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms