Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Dgcr8Q9EQM6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dgcr8Q9EQM6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dgcr8Q9EQM6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dgcr8Q9EQM6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dgcr8Q9EQM6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dgcr8Q9EQM6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dgcr8Q9EQM6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dgcr8Q9EQM6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dgcr8Q9EQM6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dgcr8Q9EQM6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dgcr8Q9EQM6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms