Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn1Q9EPL2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn1Q9EPL2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn1Q9EPL2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn1Q9EPL2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clstn1Q9EPL2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clstn1Q9EPL2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms