Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf4Q9DAW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf4Q9DAW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf4Q9DAW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf4Q9DAW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf4Q9DAW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms