Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PudpQ9D5U5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PudpQ9D5U5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PudpQ9D5U5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms