Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Iqcf3Q9D498 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Iqcf3Q9D498 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Iqcf3Q9D498 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Iqcf3Q9D498 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Iqcf3Q9D498 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Iqcf3Q9D498 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Iqcf3Q9D498 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Iqcf3Q9D498 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Iqcf3Q9D498 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Iqcf3Q9D498 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms