Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
4933428G20RikQ9D3X4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms