Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D3J9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D3J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D3J9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D3J9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D3J9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D3J9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D3J9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D3J9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D3J9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D3J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D3J9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D3J9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms