Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18l2Q9D174 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l2Q9D174 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms