Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3bQ9CZT8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab3bQ9CZT8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab3bQ9CZT8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3bQ9CZT8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms