Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl11Q9CXW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl11Q9CXW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms