Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Xrcc3Q9CXE6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Xrcc3Q9CXE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Xrcc3Q9CXE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Xrcc3Q9CXE6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182 ms